Atari har fortsatt store økonomiske problemer. Et knapt overskudd på 45 millioner kroner under regnskapsåret 2005 (april 2004-mars 2005) ble omgjort til et dramatisk tap på 500 millioner kroner under siste års regnskapsår (april 2005-mars 2006). Under det kommende året skal Atari kutte ned på personalet med 25 prosent for å senke sine kostnader. Eventuelt kan det også handle om salg av ytterligere utviklingsstudioer. Dårligere enn forventet salg av Marc Ecko's Getting Up: Contents under Pressure og The Matrix: Path of Neo nevnes som årsaker bak det dårlige resultatet. Dessutem skylder Atari også på overgangsfasen mellom konsollgenerasjonene som gjort at interessen for de eldre konsollene har synket kjappere enn forventet.